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番木瓜(Carica papaya)又稱木瓜，是十字花目番木瓜科水果。番木瓜不僅可以作為水果食用，還有重要的藥用價值。作為一種重要的熱帶植物，番木瓜的產量和質量常常受到病蟲害的嚴重影響。其中為害最普遍及最嚴重的首推由病毒引起的番木瓜環(huán)斑花葉病，除此之外，還有10多種真菌病害，如炭疽病、葉斑病。為了減少損失，目前已經培育了抗特異類型病毒的轉基因番木瓜品種。盡管如此，單一的轉基因品種仍然無法抵御其他病害的威脅。為了更好從分子水平研究番木瓜，南開大學和美國的研究機構進行的一項大型聯合研究，于2008年獲得了番木瓜基因組的首個草圖。這個草圖拼出了90％的番木瓜基因編碼序列。 

miRNA是一類21個核苷酸左右的小分子，它可以直接負調控其靶基因的表達。研究表明，植物miRNA參與了生長發(fā)育，營養(yǎng)代謝，生物和非生物逆境等多方面的功能。結合已有的小RNA深度測序結果于基因組序列，利用生物信息學技術手段，植物分子研究組鑒定了75個保守的miRNA和11個新的miRNA，并預測了這些miRNA對應的靶基因。這些miRNA直接調控植物生長發(fā)育和抗逆等方面的關鍵基因。同時，該研究還鑒定了幾個番木瓜特有的miRNA調控途徑，這些途徑可能直接參與番木瓜的抗病功能。 

該研究以Identification of miRNAs and miRNA?mediated regulatory pathways in Carica papaya為題發(fā)表在Planta上。該項目得到了西部之光和135工程的資助。 

番木瓜miRNA的鑒定策略