能源植物分子育種組篩選出小桐子基因表達(dá)分析的內(nèi)參基因
小桐子(Jatropha curcas)是較具發(fā)展?jié)摿Φ纳锬茉粗参镏弧=陙?lái),有關(guān)小桐子的基因功能研究越來(lái)越深入,但迄今為止,還沒(méi)有針對(duì)小桐子基因表達(dá)分析篩選出合適的內(nèi)參基因。隨著RT-qPCR實(shí)驗(yàn)技術(shù)的廣泛應(yīng)用,在分析基因的表達(dá)量時(shí)選擇合適的內(nèi)參基因作為參考標(biāo)準(zhǔn)顯得尤為重要。
版納植物園能源植物分子育種組的博士研究生張露在導(dǎo)師徐增富研究員的指導(dǎo)下,采用RT-qPCR技術(shù)并結(jié)合qBasePLUS分析軟件,從11個(gè)常用的候選內(nèi)參基因中為小桐子篩選出了適合于不同實(shí)驗(yàn)樣品集(共20個(gè)樣品)的內(nèi)參基因組合。研究結(jié)果表明,在不同發(fā)育階段(營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)和生殖生長(zhǎng))的組織樣品集中,Actin、GAPDH和EF1α為最佳的內(nèi)參基因組合;在非生物逆境脅迫(脫水脅迫和冷脅迫)的組織樣品集中,Actin、GAPDH和TUB5為最佳的內(nèi)參基因組合;在單獨(dú)營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)階段的組織樣品集中,Actin和TUB8為最佳的內(nèi)參基因組合;在單獨(dú)生殖生長(zhǎng)階段的組織樣品,GAPDH和EF1α為最佳的內(nèi)參基因組合;在單獨(dú)脫水脅迫的樣品集中,TUB5和TUB8為最佳的內(nèi)參基因組合;在單獨(dú)冷脅迫的樣品集中,GAPDH和Actin為最佳的內(nèi)參基因組合。此外,有關(guān)脫水脅迫樣品集中內(nèi)參基因組合的篩選結(jié)果也在本研究中得到標(biāo)準(zhǔn)化驗(yàn)證。不同的實(shí)驗(yàn)樣品集應(yīng)選擇相應(yīng)的內(nèi)參基因組合作為基因表達(dá)量分析,本研究結(jié)果對(duì)小桐子基因功能研究中的基因表達(dá)分析具有很大的參考價(jià)值。
相關(guān)研究結(jié)果以Selection of Reliable Reference Genes for Gene Expression Studies in the Biofuel Plant Jatropha curcas Using Real-Time Quantitative PCR為題,發(fā)表在國(guó)際期刊International Journal of Molecular Sciences上。