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      蓖麻基因組bZIP家族鑒定與表達分析

      發(fā)布時間:2014-02-19
      來源:熱帶森林生態(tài)學重點實驗室

      蓖麻是雙子葉胚乳型植物的典型代表,是大戟科中重要的油料作物,其種子油被廣泛地應用在工業(yè)上。bZIP(basic leucine zipper)轉(zhuǎn)錄因子廣泛分布于真核生物中,在植物中涉及多種生物進程,其中ABF亞族更是ABA信號途徑中重要的調(diào)控因子。 

      分子遺傳與育種組研究發(fā)現(xiàn)ABA對蓖麻油脂累積具有顯著作用,bZIP轉(zhuǎn)錄因子可能參與ABA調(diào)控蓖麻油脂合成信號途徑,為此研究人員在蓖麻全基因組鑒定得到蓖麻bZIP家族所有成員,進一步對蓖麻bZIP家族基因結(jié)構(gòu)、蛋白結(jié)構(gòu)、二聚化特性、進化以及表達譜分析。得到以下結(jié)論:蓖麻bZIP家族成員49個,根據(jù)保守bZIP結(jié)構(gòu)域特征將bZIP家族分為11個組(Group);對蓖麻bZIP轉(zhuǎn)錄因子結(jié)構(gòu)域外的保守基序(Motif)、基因結(jié)構(gòu)、進化關系等生物信息學分析,初步揭示了這兩個家族成員在進化和功能上的相關性;對擬南芥和蓖麻中bZIP成員系統(tǒng)發(fā)生分析,均表明二者既存在同源性,又在進化中有基因丟失現(xiàn)象;基于DGE高通量表達測序數(shù)據(jù)以及公開的蓖麻五個組織RNA-Seq數(shù)據(jù)分別對蓖麻bZIP基因的組織表達模式分析,得到種子特異性表達的或者潛在與油脂相關的基因。 

      本研究結(jié)果為了解bZIP轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)和功能提供了重要的信息。同時也為揭示蓖麻bZIP基因與蓖麻生長和發(fā)育,尤其是在種子儲存物質(zhì)累積中作用提供線索。相關研究結(jié)果以Genomic surveys and expression analysis of bZIP gene family in castor bean (Ricinus communis L.)為題發(fā)表在Planta上。 

      本文作者:靳正偉

      責任編輯:張云冰_151c53
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