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      版納植物園篩選出美藤果基因表達分析的內參基因

      發(fā)布時間:2015-06-08
      來源:科技外事處

        美藤果是大戟科、多年生木質藤本植物,其種子含油率高達40%,且從美藤果種子中榨取的植物油富含多元不飽和脂肪酸,尤其是富含類似于深海魚油的ω-3脂肪酸,可用于食品、保健、制藥、化妝品等方面,對調整血脂、預防心血管疾病、保養(yǎng)肌膚等具有顯著的作用。據(jù)最新的研究表明,美藤果油也可用于加工生物柴油。因此,美藤果是一種具有很大發(fā)展?jié)摿Φ谋=≈参锖湍茉粗参铩=陙恚嘘P美藤果的研究越來越深入,但迄今為止,還沒有針對美藤果基因表達分析篩選出合適的內參基因。隨著RT-qPCR實驗技術的廣泛應用,在分析基因的表達量時選擇合適的內參基因作為參考標準顯得尤為重要。 

        版納植物園熱帶植物資源可持續(xù)利用重點實驗室能源植物分子育種組與科大聯(lián)合培養(yǎng)的博士研究生牛龍見等在導師徐增富研究員的指導下,采用RT-qPCR技術并結合ΔCtgeNormBestKeeperNormFinder 四種運算方法,首先獲得不同算法下得出的最適內參基因,然后通過RefFinder軟件綜合四種算法的結果,最終從12個常用的候選內參基因中篩選出5個實驗樣品集(共16個樣品)的內參基因組合。結果表明:UCEACTPLA在美藤果幼苗中最穩(wěn)定;在成年美藤果植株中RPS13CYCEF1a表達最穩(wěn)定;在花發(fā)育過程中,PLAACTUCE最適合用作內參基因;在種子發(fā)育過程中,UCERPS13RPII是最穩(wěn)定表達的內參基因;在所有的組織樣品中,UCEACTEF1a是最佳選擇的內參基因。本研究結果為利用RT-qPCR技術準確地分析美藤果基因在不同生長發(fā)育階段的表達奠定了重要的基礎。  

         相關研究結果以Selection of reliable reference genes for gene expression studies of a promising oilseed crop, Plukenetia volubilis, by real-time quantitative PCR為題,發(fā)表于國際專業(yè)期刊International Journal of Molecular Sciences(2015, 16, 12513-12530) 

      本文作者:張禮鳳 牛龍見

      責任編輯:張維靜_151c53
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