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      版納植物園建立我國首個熱帶森林樹種DNA條形碼數(shù)據(jù)庫

      發(fā)布時間:2015-07-13
      來源:科技外事處

        隨著全球氣候變化的影響及人類活動的加劇,特別是熱帶經(jīng)濟作物如橡膠等的大面積種植,西雙版納作為我國生物多樣性最豐富的地區(qū)之一,目前面臨嚴重的威脅。DNA條形碼能夠利用一小段DNA序列快速進行物種鑒定,為生物多樣性保護提供了一個極為有效的可靠途徑。 

        版納植物園植物系統(tǒng)發(fā)育與保護生物學(xué)研究組從2008年起,對西雙版納國家級自然保護區(qū)內(nèi)不同植被類型的熱帶森林開展了區(qū)域DNA條形碼研究。從隸屬于76科、259屬、655樹種的2052個個體中獲得了rbcLmatKtrnH-psbAITS四個DNA條形碼片段的5583條序列;利用BLAST方法,結(jié)合傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)觀察及專家鑒定,發(fā)現(xiàn)并糾正了野外鑒定錯誤的99個個體。此外,研究發(fā)現(xiàn)作為國際植物DNA條形碼聯(lián)盟推薦的標準條形碼的rbcLmatK,對西雙版納熱帶森林喬木樹種的鑒別能力有限,而補充條碼ITS雖然受到測序成功率不高的限制,但其樹種鑒別能力最高,進而建議將其與trnH-psbA聯(lián)合共同列為西雙版納地區(qū)熱帶森林樹種的DNA條形碼;與世界其它熱帶地區(qū)相比,西雙版納地區(qū)DNA條形碼的樹種鑒別能力較低,推測可能與物種組成及共存種之間的差異有關(guān)。 

        本項研究首次建立了我國熱帶森林樹種的DNA條形碼數(shù)據(jù)庫,為生物多樣性的大尺度調(diào)查提供了有力的工具,促進了系統(tǒng)發(fā)育群落生態(tài)學(xué)等相關(guān)學(xué)科的快速發(fā)展;同時,為進一步對該地區(qū)開展系統(tǒng)發(fā)育多樣性的評估和自然保護區(qū)合理有效的規(guī)劃,以及珍稀瀕危物種的保護提供了可能,為群落系統(tǒng)發(fā)育進化樹的構(gòu)建和外來入侵種的快速鑒定提供了重要的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。 

        研究成果以Application of DNA Barcodes in Asian Tropical Trees – A Case Study from Xishuangbanna Nature Reserve, Southwest China為題發(fā)表在PLoS ONE上。 

            本項目受到科技部科技基礎(chǔ)性工作專項2012FY110400資助。

      本文作者:慈秀芹

      責(zé)任編輯:張維靜_151c53
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