樟科植物葉綠體比較基因組研究獲進展
樟科植物廣泛分布于世界熱帶及亞熱帶地區(qū)，約有60屬、3500種。樟科絕大多數(shù)種類為喬木，具有重要的林業(yè)資源價值和藥物開發(fā)利用潛力。然而，就目前對其開展的林木遺傳學(xué)及比較基因組學(xué)研究仍然十分有限。近期生物多樣性研究組對該科兩個潤楠屬植物進行了葉綠體比較基因組學(xué)研究，首次對樟科植物葉綠體基因組的基因和結(jié)構(gòu)進行比較，定位突變位點，注釋基本基因功能，并篩選出可用于親緣進化關(guān)系分析的高變區(qū)域。
版納植物園生物多樣性研究組研究人員以分布于中國西南部高海拔地區(qū)的滇潤楠（Machilus yunnanensis Lecomte）和越南北部低海拔地區(qū)的銹毛潤楠（Machilus balansae (Airy Shaw) F. N. Wei and S. C. Tang）為實驗材料，用138對引物對葉綠體基因組進行全覆蓋測序。通過比對發(fā)現(xiàn)，樟科潤楠屬植物的葉綠體基因組大小約為153 kb，近似于近緣科蠟梅科夏蠟梅屬植物；兩個潤楠葉綠體基因共有297個突變位點，突變率與中國人參各品系間的差異相當(dāng)；其中包括231次替換事件、65次插入缺失事件和一次位于ccsA-ndhD區(qū)的小倒位事件；95次替換事件發(fā)生在基因編碼區(qū)，表明具有進化選擇的可能性；36次缺失事件造就了可用于遺傳分析的SSR位點；突變位點在葉綠體基因組上呈現(xiàn)非隨機性分布，共有七個高聚集區(qū)，極具系統(tǒng)分析潛力但完全與傳統(tǒng)分析序列不同。
研究結(jié)果揭示了樟科植物葉綠體基因組的大小和結(jié)構(gòu)；找到了先前應(yīng)用于樟科系統(tǒng)學(xué)研究的葉綠體基因片段在種屬級別上缺乏分辨力的原因，為后續(xù)該科的系統(tǒng)學(xué)研究提供了有效的參考；同時也明確了樟科的一些大屬如潤楠屬存在種間遺傳差異小的事實。
本研究以Comparative analysis of complete chloroplast genome sequences of two tropical trees Machilusyunnanensis and Machilusbalansae in the family Lauraceae為題發(fā)表于FrontiersinPlantScience雜志。
滇潤楠（Machilus yunnanensis）
銹毛潤楠（Machilus balansae）
葉綠體基因組
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