百脈根LBD基因電子表達譜和部分基因表達驗證
LATERAL ORGAN BOUNDARIES DOMAIN (LBD) 基因家族是在擬南芥中發(fā)現(xiàn)的高等植物所特有的一類基因,其編碼的蛋白中含有LATERAL ORGAN BOUNDARIES (LOB) 結(jié)構(gòu)域。根據(jù)LBD蛋白結(jié)構(gòu)中是否含有亮氨酸拉鏈類似基序,將LBD基因分為兩類:第一類(class I)LBD蛋白結(jié)構(gòu)域中包含完整的亮氨酸拉鏈基序;第二類 (class II) LBD蛋白結(jié)構(gòu)域中不包含亮氨酸拉鏈基序。LBD基因一般在側(cè)生器官與莖尖分生組織的邊界處、側(cè)生器官的近軸一側(cè)的基部表達,并呈現(xiàn)出在多種組織內(nèi)特異表達的特征。在豆科模式植物蒺藜苜蓿和百脈根中,LBD基因控制其葉枕的發(fā)育,這為我們進一步探索LBD基因功能提供了新的認識。
版納植物園植物功能基因研究組的博士研究生陽天泉,在蒺藜苜蓿和百脈根全基因組水平篩選和鑒定LBD基因家族,并對基因結(jié)構(gòu)、系統(tǒng)進化、進化壓力、染色體定位以及基因表達模式進行了分析。在蒺藜苜蓿和百脈根中分別鑒定到57個和38個LBD基因,它們在染色體中呈不均勻分布。該家族基因結(jié)構(gòu)簡單,多為1-2個外顯子。對百脈根LBD基因表達模式分析顯示,LjLBD1, LjLBD6, LjLBD11和LjLBD32在復葉中具有較高表達。酵母雙雜交顯示LjLBD6和LjLBD11存在體外互作,可能暗示LjLBD11與LjLBD6共同調(diào)控復葉發(fā)育。
該研究成果以Genome-Wide Identification, Evolutionary Analysis and Expression Profiles of LATERAL ORGAN BOUNDARIES DOMAIN Gene Family in Lotus japonicas and Medicago truncatula為題,發(fā)表于PLOS ONE。
本研究得到了國家自然科學基金(31500989)的資助,在此表示感謝。
百脈根LBD基因電子表達譜和部分基因表達驗證