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      樟科植物DNA條形碼研究方面取得新進展

      發(fā)布時間:2017-04-25
      來源:科技外事處

        從網(wǎng)上買的楠木(楠木Phoebe zhennan)手串是否真實?  

        放入炒鍋的香葉(月桂 Laurusnobilis)真如超市標(biāo)碼上所寫?  

        樟科植物中無花無果物種如何鑒定? 

          ……  

        DNA條形碼技術(shù)的應(yīng)用,使得這些難題都有方法可循。 

        樟科植物作為常見的重要經(jīng)濟林木,在林業(yè)、輕工、醫(yī)藥等領(lǐng)域都占有重要的地位,大多數(shù)種類集中分布于長江以南各省區(qū),然而對其物種的把握與識別卻始終是困擾大家的一個難題,阻礙了對其實施有效的生物多樣性保護與開發(fā)利用。物種的準(zhǔn)確鑒定是一切生產(chǎn)、應(yīng)用與研究至關(guān)重要的第一步。為了探尋與評估DNA條形碼技術(shù)對這一難題的解決能力,版納植物園李捷研究組的博士研究生劉志芳和慈秀芹利用該研究組在樟科植物分類與系統(tǒng)學(xué)方面近二十來年的研究與積累,將DNA條形碼技術(shù)與樟科形態(tài)學(xué)特征相結(jié)合,分別從條形碼的鑒定能力、物種糾錯能力和系統(tǒng)演化等三個方面進行了分析與探討。研究發(fā)現(xiàn)國際條形碼組織推薦的核心條形碼matKrbcL與補充條形碼trnH-psbAITSITS2,除對基部的部分類群有好的鑒定表現(xiàn)外,整體上對樟科植物的物種鑒定能力較弱;但是條形碼ITS,如果不考慮序列的擴增與測序困難問題,其鑒定能力最佳,推薦作為樟科植物的有力條形碼;條形碼技術(shù)與形態(tài)鑒定相結(jié)合,對樟科物種鑒定糾錯率高達10.8%;條形碼數(shù)據(jù)可以一定程度地重建樟科植物的系統(tǒng)演化。此項研究對林業(yè)、輕工、醫(yī)藥領(lǐng)域利用樟科植物資源具有較高的參考價值,對樟科植物的分類與系統(tǒng)發(fā)育研究以及種質(zhì)資源保護也有重要的意義,同時該研究也為正在開展的東南亞等地區(qū)樟科植物調(diào)查提供了數(shù)據(jù)參考。 

            該研究得到NSFC (31370245, 31500454)MOST (2011FY1202004,2012FY110400)基金的資助,以及中科院東南亞生物多樣性研究中心(Y4ZK111B01)的資助,研究結(jié)果以DNA Barcoding Evaluation and Implications for Phylogenetic Relationships in Lauraceae from China為題發(fā)表于PLoS ONE

      基于BLAST NJ樹的分析,單片段與組合片段在種水平和屬水平的鑒定能力統(tǒng)計(A: n ≥ 1; B: n 2

      本文作者:劉志芳

      責(zé)任編輯:張維靜_151c53
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