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      版納植物園樟科植物葉綠體比較基因組學研究再獲進展

      發(fā)布時間:2017-10-30
      來源:科技外事處

        楠木是中國傳統(tǒng)的名貴木材之一,主要來源于樟科潤楠-鱷梨屬群樹種。然而,這一屬群各屬內(nèi)部的種間關(guān)系尚不明晰。繼潤楠屬和鱷梨屬葉綠體基因組研究的報道之后,版納植物園生物多樣性研究組研究人員以分布于我國南部地區(qū)的紫楠(Phoebe sheareri (Hemsl.) Gamble)和四川盆地的峨眉楠(Phoebe omeiensis R.H. Miao)為實驗材料,通過長鏈PCR和二代測序技術(shù)完成了葉綠體基因組進行全覆蓋測序。通過比對發(fā)現(xiàn),樟科楠屬植物的葉綠體基因組大小約為153 kb,與近緣屬潤楠屬(Song et al. 2015, Frontiers in Plant Science, 6: 662)和鱷梨屬(Song et al. 2016, Canadian Journal of Forest Research, 46: 1293)植物相似;兩個楠木葉綠體基因組共有222個突變位點,包括146次替換事件、73次插入缺失事件和3次小倒位事件;突變位點在葉綠體基因組上呈現(xiàn)非隨機性分布,共有38個聚集區(qū)。基于該研究結(jié)果,研究人員對楠屬植物葉綠體基因組的基因和結(jié)構(gòu)進行比較,定位突變位點,并利用高變區(qū)域構(gòu)建進化樹,明確了十二種國產(chǎn)楠屬植物的親緣關(guān)系。研究結(jié)果再次證實了樟科植物葉綠體基因組也存在種間遺傳差異小的事實,明確了樟科植物葉綠體基因組的高聚集區(qū)序列與傳統(tǒng)分析序列不同,并初步劃定了國產(chǎn)楠屬植物的四個主要分組。 

              該成果以Comparative analysis of complete chloroplast genome sequences of two subtropical trees,Phoebe sheareriandPhoebe omeiensis(Lauraceae)為題在線發(fā)表于國際學術(shù)期刊Tree Genetics & Genomes

      楠屬植物葉綠體基因組

      紫楠(Phoebe sheareri (Hemsl.) Gamble)和峨眉楠(Phoebe omeiensis R.H. Miao

      本文作者:宋鈺

      責任編輯:張維靜_151c53
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