版納植物園在葉綠體比較基因組學(xué)研究再獲進(jìn)展
樟科油丹屬樹種木材質(zhì)優(yōu)，國際市場(chǎng)上的商品名為“medang”，和楠木樹種的親緣關(guān)系較近。前期分子系統(tǒng)學(xué)研究表明油丹屬為復(fù)系類群，與潤(rùn)楠屬、鱷梨屬和楠屬等的系統(tǒng)關(guān)系尚不明晰。生物多樣性研究組研究人員以分布于印度南部的油丹模式種Alseodaphne semecarpifolia Nees和分布于我國云南的極危種細(xì)梗油丹（A. gracilis Kosterm）和黃連山油丹（A.huanglianshanensis H. W. Li & Y. M. Shui）為實(shí)驗(yàn)材料，通過二代測(cè)序技術(shù)完成了葉綠體基因組全覆蓋測(cè)序。
通過比對(duì)發(fā)現(xiàn)，樟科油丹屬植物的葉綠體基因組大小約為153 kb，比近緣屬潤(rùn)楠屬、鱷梨屬及楠屬植物的葉綠體基因組大，比土楠屬植物的葉綠體基因組小。差異主要源自連接單拷貝區(qū)和反向重復(fù)區(qū)的兩個(gè)基因ycf1和ycf2。兩基因的長(zhǎng)度變化造就了反向重復(fù)區(qū)的縮減和擴(kuò)張，直接影響葉綠體基因組的大小。在油丹的整個(gè)葉綠體基因組上，聚集突變位點(diǎn)最多的區(qū)域分別是trnG-UCC、ndhF-rpl32、rpl32-trnL和ycf1，而傳統(tǒng)系統(tǒng)分析序列上的突變位點(diǎn)則較為少見，是先前用于樟科系統(tǒng)學(xué)研究的葉綠體基因片段在種屬級(jí)別上缺乏分辨力的原因。利用葉綠體基因組序列構(gòu)建的十二種樟科植物的系統(tǒng)進(jìn)化樹進(jìn)一步確認(rèn)了樟科內(nèi)部由油丹屬、楠屬、鱷梨屬和潤(rùn)楠屬構(gòu)成的單系屬群。
該成果以Complete plastid genome sequences of threetropical Alseodaphne trees in the family Lauraceae為題發(fā)表于國際學(xué)術(shù)期刊Holzforschung。
油丹屬（AlseodaphneNees）植物葉綠體基因組
黃連山油丹（Alseodaphnehuanglianshanensis H. W. Li & Y. M. Shui）（攝影：劉冰）
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