“海稻86”耐鹽相關(guān)基因定位取得進(jìn)展
耐鹽是復(fù)雜的數(shù)量性狀,在不同的水稻品種及不同的生長(zhǎng)階段涉及的耐鹽響應(yīng)和調(diào)控基因都會(huì)有所差異,多方法多途徑綜合解析水稻的耐鹽機(jī)制,挖掘耐鹽的主效基因或QTL(數(shù)量性狀基因座),有助于為培育水稻耐鹽新品種提供理論指導(dǎo)。“海稻86”是我國(guó)重要的耐鹽水稻種質(zhì)資源,但對(duì)其耐鹽性的遺傳及分子機(jī)理解析的研究仍然較少。
版納植物園熱帶稻種保護(hù)與遺傳改良研究組的研究發(fā)現(xiàn),在鹽土環(huán)境條件下,耐鹽種質(zhì)“海稻86”苗期表現(xiàn)出比普通水稻品種更高的耐鹽性,遺傳分析結(jié)果顯示耐鹽對(duì)鹽敏感為顯性。進(jìn)一步利用“海稻86”為供體親本,云南粳型水稻品種“滇粳優(yōu)1號(hào)”為受體親本,構(gòu)建了F2群體并進(jìn)行BSA(分離群體分組分析法)測(cè)序分析,在1號(hào)染色體上確定了一個(gè)2.78 Mb的區(qū)域作為候選區(qū)域。為了進(jìn)一步縮小候選區(qū)域范圍,我們利用SSR分子標(biāo)記進(jìn)行QTL定位,最終獲得了一個(gè)對(duì)表型貢獻(xiàn)率超過(guò)60%的主效QTL (LOD>14)。該QTL位于RM8904-RM493標(biāo)記之間,遺傳距離為5.49 cM,該 QTL被命名為qST1.1。我們進(jìn)一步培育片段替換系和滲入系,通過(guò)表型證實(shí)qST1.1確實(shí)與“海稻86”的耐鹽性有關(guān)。這一新發(fā)現(xiàn)的QTL將有助于水稻耐鹽機(jī)理的解析和利用MAS選育優(yōu)質(zhì)耐鹽水稻品種。
相關(guān)研究結(jié)果近期以Identification and Validation a Major QTL from “Sea Rice 86” Seedlings Conferred Salt Tolerance為題,發(fā)表在Agronomy上。碩士研究生吳鋒玲為該文第一作者,徐鵬研究員和余迪求研究員為該文的共同通訊作者。
qST1.1定位及驗(yàn)證結(jié)果
滲入系IL-T22耐鹽表型分析