水、陸稻根系微生物組的環(huán)境適應(yīng)性及陸稻根系促生菌研究取得進展
微生物可以直接或間接與植物相互作用以促進宿主植物的生長、抗病和提升脅迫耐受力(如干旱等非生物脅迫),這些微生物統(tǒng)稱為植物微生物組(也被稱為植物的第二基因組)。盡管前人已對水稻和其他重要農(nóng)作物的根系微生物組群落結(jié)構(gòu)、空間分布及短期干旱脅迫對根系微生物組的影響進行了廣泛的研究,但對自然水、陸環(huán)境下水、陸稻(生態(tài)型)的根系微生物組群落組裝和變異知之甚少。此外,陸稻(Oryza sativa L.)是完全不同于灌溉水稻的陸生生態(tài)型,其能適應(yīng)干旱脅迫和旱地有氧通氣環(huán)境,相關(guān)根系微生物資源尚未被挖掘利用。
版納植物園熱帶稻種保護與遺傳改良研究組碩士研究生龐志強在導師徐鵬研究員和余迪求研究員共同指導下以典型的陸稻和水稻品種為材料基礎(chǔ),研究了水、陸環(huán)境條件下的水、陸稻根系微生物組的差異組裝。通過高通量測序和傳統(tǒng)分離培養(yǎng)相結(jié)合的方法,鑒定不同生態(tài)型的水、陸稻根系細菌和真菌組成的環(huán)境適應(yīng)性及篩選陸稻根系促生耐旱等功能微生物。結(jié)果表明:水、陸環(huán)境對兩種生態(tài)型稻種根系微生物組群落組成有顯著的影響,環(huán)境效應(yīng)大于生態(tài)型品種效應(yīng),從灌溉水田轉(zhuǎn)變到旱地環(huán)境兩種生態(tài)型稻種的根系微生物組多樣性都顯著降低。根系微生物組對旱地環(huán)境的總體反應(yīng)是由腸桿菌科(Enterobacteriaceae),沙雷氏菌屬(Serratia)和子囊菌門(Ascomycota)所驅(qū)動。有趣的是,灌溉水稻生態(tài)型從水田到旱地這一過程會特異性富集嗜熱油菌綱(Thermoleophilia)和放線菌門(Actinobacteria)等部分革蘭氏陽性菌類微生物。相關(guān)研究結(jié)果以Environmental adaptation of the root microbiome in two rice ecotypes為題,發(fā)表于國際微生物學期刊Microbiological research。
雨養(yǎng)旱地與灌溉水田環(huán)境下的水陸稻根系微生物組
在前期實驗基礎(chǔ)上,作者進一步分離篩選陸稻根系功能微生物(組),接種實驗表明:來自陸稻根系的內(nèi)生真菌能夠顯著提高水稻幼苗的株高、地上部鮮重、抗氧化能力、脯氨酸和可溶性糖含量。相關(guān)研究結(jié)果以Microbial Diversity of Upland Rice Roots and Their Influence on Rice Growth and Drought Tolerance為題,發(fā)表于國際微生物學期刊Microorganisms。
分離自陸稻的根系內(nèi)生真菌能促進水稻幼苗正常生長及干旱耐受力
總的來說:研究表明不同環(huán)境條件和水稻生態(tài)型導致根系微生物組的重組,此外,溫室實驗表明陸稻根系微生物能促進干旱和灌溉條件下植物的生長,可能是促進作物生長和耐旱的有效微生物資源。版納植物園2018級碩士研究生龐志強為該兩篇論文的第一作者,徐鵬研究員和余迪求研究員為論文共同通訊作者。