九九99国产精品视频,韩国美女一区二区,久久国产热这里只有精品,日本一区二区在线看

      您當(dāng)前的位置:首頁 > 科學(xué)研究 > 科研動(dòng)態(tài)

      葉綠體基因組超級(jí)條形碼能否用于樟科植物的物種鑒定?

      發(fā)布時(shí)間:2021-03-24
      來源:科技外事處

        從傳統(tǒng)的形態(tài)分類到DNA條形碼技術(shù),都是為了解決地球上物種分類及鑒定問題,從而更有效地保護(hù)和持續(xù)利用生物多樣性資源。目前植物DNA條形碼正從單個(gè)或少數(shù)DNA片段向多個(gè)DNA片段組合、葉綠體基因組數(shù)據(jù)及基因組淺層測(cè)序等方面發(fā)展,并且已經(jīng)在諸多研究中得到了廣泛地應(yīng)用,尤其是基因組測(cè)序技術(shù)的巨大改進(jìn),使研究人員探索基因組超級(jí)DNA條形碼成為可能。 

        版納植物園李捷研究員團(tuán)隊(duì),多年來致力于樟科植物的分類學(xué)、系統(tǒng)發(fā)育與生物地理學(xué)研究。樟科植物作為熱帶雨林、亞熱帶常綠闊葉林等森林植被重要組成物種,快速準(zhǔn)確地對(duì)該類群植物進(jìn)行物種鑒定,對(duì)其進(jìn)行種質(zhì)資源保護(hù)、群落生態(tài)生物地理學(xué)等研究的前提與基礎(chǔ)。然而,樟科植物中許多類群在分類系統(tǒng)學(xué)上一直存在爭(zhēng)議,全面而深入的樟科植物分類及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系研究仍舊非常欠缺,DNA條形碼技術(shù)為解決這一難題提供了契機(jī) 

        研究團(tuán)隊(duì)通過廣泛的樣本收集,利用葉綠體全基因組與核基因數(shù)據(jù)對(duì)樟科25屬、133種的191個(gè)個(gè)體進(jìn)行分類鑒定以及系統(tǒng)發(fā)育研究,探討了傳統(tǒng)葉綠體條形碼、專屬條形碼以及葉綠體全基因組對(duì)樟科物種的鑒定能力,同時(shí)利用葉綠體基因組數(shù)據(jù)開展了系統(tǒng)發(fā)育研究與核質(zhì)一致性分析。研究發(fā)現(xiàn)葉綠體全基因組只能鑒定約60%的樟科物種,這與傳統(tǒng)的標(biāo)準(zhǔn)條形碼和專屬葉綠體DNA條形碼片段的鑒定率(40-50%)相比僅有適度的提高,但葉綠體基因組在糾正物種錯(cuò)誤鑒定以及發(fā)現(xiàn)隱存種與新物種方面優(yōu)勢(shì)明顯。同時(shí),研究還進(jìn)一步揭示了樟科植物類群間復(fù)雜的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,在核質(zhì)一致性分析中發(fā)現(xiàn)除厚殼桂族和無根藤族外,其余類群在葉綠體基因組與核基因間存在顯著的基因樹沖突與廣泛的不一致性 

        研究結(jié)果近期以Can plastid genome sequencing be used for species identification in the Lauraceae?為題發(fā)表于Botanical Journal of the Linnean Society版納植物園綜合保護(hù)中心植物系統(tǒng)發(fā)育與保護(hù)研究組劉志芳博士為論文第一作者,李捷研究員、英國(guó)愛丁堡皇家植物園Peter M. Hollingsworth教授、愛丁堡大學(xué)Alex D. Twyford教授以及中國(guó)科學(xué)院昆明植物研究所楊俊波高級(jí)工程師為論文共同通訊作者。該研究得到了國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目、中科院項(xiàng)目、科技基礎(chǔ)資源調(diào)查專項(xiàng)等項(xiàng)目的資助 

      191個(gè)葉綠體全基因組及其提取基因鑒定能力比較

      基于ML分析80個(gè)GetOrganelle組裝的核質(zhì)基因樹沖突/一致性分析

      本文作者:劉志芳

      責(zé)任編輯:zhangwj_151c53
      附件: