国产精品久久精品_榕屬葉綠體基因組比較研究進(jìn)展----中國科學(xué)院西雙版納熱帶植物園

　　葉綠體基因組因其基因組小、突變率和重組率低的特點(diǎn)，近年來(lái)被廣泛用于植物系統發(fā)育、分子進(jìn)化、和譜系地理學(xué)研究。榕屬（Ficus）作為桑科的最大屬，又是熱帶雨林的關(guān)鍵物種，其系統發(fā)育關(guān)系還沒(méi)有很好的解決，同時(shí)榕屬物種具有多樣的生態(tài)型，體現了對不同生境的高度適應性。盡管近年來(lái)關(guān)于榕屬葉綠體基因組的研究有所發(fā)展，但是還缺少一個(gè)基于較大樣本量的全屬水平的葉綠體基因組的結構變異及系統進(jìn)化的分析。

　　中國科學(xué)院西雙版納熱帶植物園（以下簡(jiǎn)稱(chēng)版納植物園）協(xié)同進(jìn)化研究組章正仁等對囊括了6個(gè)榕亞屬的24種葉綠體基因組進(jìn)行了全面分析，揭示了基因組中的高變區域以及蛋白編碼基因的選擇進(jìn)化模式。并進(jìn)一步結合先前發(fā)表的40個(gè)榕屬葉綠體基因組，進(jìn)行了系統發(fā)育分析和物種分化時(shí)間的估算。結果表明：榕屬葉綠體基因組在結構上具有很高的保守性，鑒定到8個(gè)分化熱點(diǎn)區域，為區分近緣種以及群體水平的譜系地理分析提供候選區域。三個(gè)蛋白編碼基因（clpP, rbcL, ccsA）受到正選擇作用, 可能有助于不同生活型的榕樹(shù)對不同生境的適應，其余蛋白質(zhì)編碼基因都經(jīng)歷了純化選擇。同時(shí)，基于葉綠體基因組數據構建的系統發(fā)育樹(shù)為解決榕屬植物的系統發(fā)育提供了新的見(jiàn)解。葉綠體基因組的分化時(shí)間估計則與基于核基因的分化時(shí)間相似，大約起源于74.5 百萬(wàn)年前，快速分化于中新世早期至中期，這一時(shí)間與中新世早期的全球變暖和中新世氣候適宜期相吻合。

　　相關(guān)研究成果以Comparative chloroplast genome analysis ofFicus (Moraceae): Insight into adaptive evolution and mutational hotspot regions為題，發(fā)表于植物學(xué)期刊Frontiers in Plant Science上。版納植物園協(xié)同進(jìn)化研究組碩士研究生章正仁和吉林農業(yè)大學(xué)楊雪為該論文的共同第一作者，彭艷瓊研究員和高潔副研究員為該論文的共同通訊作者。該研究得到了中國科學(xué)院西部之光青年基金項目，云南省基礎研究計劃項目和國家自然科學(xué)基金項目的聯(lián)合資助。