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      基于功能基因組研究群落物種共存機制—以Ficus為例探討干旱和防御相關(guān)基因的作用

      發(fā)布時(shí)間:2024-01-15
      來(lái)源:森林生態(tài)系統結構、功能與動(dòng)態(tài)研究組

        熱帶森林群落是地球上多樣性最高的群落之一。少數幾個(gè)屬往往這種多樣性做出了不成比例的貢獻,例如FicusInga等。大量同屬植物如何在局域群落中共存一直是群落生態(tài)學(xué)研究中的難題。生態(tài)位差異可能導致了同屬物種在群落尺度的多樣性,但當前所測量的一系列功能性狀不能很好地捕捉這一差異并解釋相關(guān)機制。

        為了探索近緣種的共存機制,中國科學(xué)院西雙版納熱帶植物園以下簡(jiǎn)稱(chēng)“版納植物園”)森林生態(tài)系統結構、功能與動(dòng)態(tài)研究組與美國University of Notre Dame的研究團隊合作,以西雙版納熱帶雨林群落中13種榕樹(shù)為研究對象,基于功能基因組學(xué)方法,研究共存榕屬(Ficus)植物800多個(gè)與干旱和防御相關(guān)的基因,利用物種功能基因相似性的詳細數據來(lái)評估共存近緣物種在干旱和防御相關(guān)基因存在差異。研究發(fā)現,共存榕屬樹(shù)種之間存在基因序列的顯著(zhù)性差異。其中,共存榕樹(shù)防御基因差異與榕樹(shù)的共存有關(guān), Janzen-Connell 假說(shuō)解釋熱帶群落物種多樣性提供了遺傳支持;而干旱相關(guān)基因序列的相似性與榕樹(shù)的共存有關(guān),表明對干旱的相似反應促進(jìn)了西雙版納熱帶雨林群落榕樹(shù)的共研究首次提供了詳細的功能基因組證據,屬植物為例,證明近緣種共存可能與干旱和防御方面的功能基因分化有關(guān)。研究結果也證實(shí)了群落轉錄組學(xué)在幫助生物多樣性維持機制探索方面的潛力。  

        相關(guān)研究成果以Functional genomics and co-occurrence in a diverse tropical tree genus: The roles of drought- and defence-related genes為題,發(fā)表于生態(tài)學(xué)經(jīng)典期刊Journal of Ecology版納植物園森林生態(tài)系統結構、功能與動(dòng)態(tài)研究組楊潔研究員為論文的第一作者University of Notre DameNathan Swenson教授為論文的通訊作者,數據分析得到了范歡博士的大力支持,曹敏研究員、王剛研究員和何云雲博士生參與了該項工作。該研究在數據采集和分析過(guò)程中得到了云南西雙版納森林生態(tài)系統國家野外科學(xué)觀(guān)測研究站補蚌工作站的支持。該研究得到了國家留學(xué)基金管理委員會(huì )、國家自然科學(xué)基金中美聯(lián)合項目、國家重點(diǎn)研發(fā)計劃、中國科學(xué)院、云南省和版納植物園十四五等項目的資助。  

          

         1. 西雙版納熱帶雨林動(dòng)態(tài)監測樣地中13種榕樹(shù)分布。  

          

         2. 森林土壤濕度對干旱和防御基因NRINTI值分布模式的影響  

      本文作者:楊潔

      責任編輯:張維靜
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