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      豆科錦雞兒屬的DNA條形碼和物種分類鑒定

      發(fā)布時間:2024-10-11
      來源:宏觀進(jìn)化研究組

      中國科學(xué)院西雙版納熱帶植物園(以下簡稱版納植物園)宏觀進(jìn)化研究組立足中國云南和東南亞豐富的生物多樣性,利用多學(xué)科理論和研究手段開展系統(tǒng)分類、宏觀進(jìn)化和生物多樣性研究。近期該研究組研究人員在被子植物大科豆科錦雞兒屬的DNA條形碼研究中取得進(jìn)展。

      豆科(Fabaceae)為雙子葉植物綱薔薇超目豆目的一個成員,是以莢果為共同特征的一個大類群,為被子植物的第3大科,約650屬,18000種,我國有172屬,148513亞種153變種。豆科植物具有重要的經(jīng)濟(jì)價值,是人類食品中淀粉、蛋白質(zhì)、油和蔬菜的重要來源之一。錦雞兒屬(Caragana)是豆科一個中等大小的屬,全世界約有100種,主要分布于亞洲和東歐,落葉灌木。在我國,錦雞兒屬主要分布于中國西北部、中部和東部各省,喜光、抗旱、耐瘠薄,不僅具有觀賞和藥用價值,還是近年來主要的防沙治沙植物。

      在傳統(tǒng)的形態(tài)分類中,錦雞兒屬主要依靠形態(tài)特征進(jìn)行物種區(qū)分,但是由于形態(tài)變異復(fù)雜以及形態(tài)趨同等因素,使得錦雞兒屬的物種分類仍存在較大問題。版納植物園宏觀進(jìn)化研究組Shabir Ahmad Rather助理研究員結(jié)合多年的野外調(diào)查和研究材料積累,對錦雞兒屬進(jìn)行了幾乎覆蓋整個國內(nèi)分布區(qū)的物種取樣和多個DNA條形碼片段測序,構(gòu)建了迄今為止取樣最全的系統(tǒng)發(fā)育樹。研究結(jié)果顯示,不同于國際DNA條形碼協(xié)會推薦的rbcL +matK條形碼組合,核nrITS和葉綠體DNA條形碼psbA-trnH在錦雞兒屬具有較高的分辨率,因而推薦nrITS+psbA-trnH的條形碼組合;利用DNA條形碼構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹,澄清了部分物種復(fù)合體的物種劃分問題,如甘肅錦雞兒(C. kansuensis)和白毛錦雞兒(C.licentiana)應(yīng)該合并到甘蒙錦雞兒(C. opulens)。然而,由于部分物種的樣品較少,本研究未能解決一些形態(tài)近緣種之間的系統(tǒng)關(guān)系,今后需要開展更多工作。該研究以DNA barcoding of recently diverging legume genera: Assessing the temperate Asian Caragana (Fabaceae: Papilionoideae)為題發(fā)表于植物系統(tǒng)分類和進(jìn)化領(lǐng)域期刊Journal of Systematics and Evolution版納植物園宏觀進(jìn)化研究組Shabir Ahmad Rather助理研究員為論文的第一作者,劉紅梅副研究員為通訊作者。研究工作得到國家自然科學(xué)基金、云南省博士后科研項(xiàng)目和科技部科技基礎(chǔ)性工作專項(xiàng)等項(xiàng)目的資助。

      1 不同DNA條形碼片段和片段組合的“Barcoding gap”分析


      本文作者:劉紅梅

      責(zé)任編輯:張維靜
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