圣路易斯華盛頓大學(xué)張博博士做客“蔡希陶論壇”
7月3日，應(yīng)中科院熱帶植物資源可持續(xù)利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)生物信息研究組組長、研究員劉長寧邀請(qǐng)，圣路易斯華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院發(fā)育生物學(xué)系助理教授、華盛頓再生醫(yī)學(xué)研究中心生物信息主管張博訪問版納植物園，并在中科院熱帶植物資源可持續(xù)利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室舉辦的系列學(xué)術(shù)報(bào)告會(huì)“蔡希陶論壇”第十八期作報(bào)告。
張博以“Discovering regulatory elements in human genome（人類基因組調(diào)控元件解析）”為題，給版納植物園科研人員和研究生作了精彩的學(xué)術(shù)報(bào)告。首先，報(bào)告介紹了人的基因組主要的調(diào)控元件包括增強(qiáng)子、啟動(dòng)子等，它們控制了打開或關(guān)閉特定的基因。目前張博實(shí)驗(yàn)室已開發(fā)了一個(gè)經(jīng)濟(jì)的聯(lián)合甲基化測序方法和軟件，研究發(fā)現(xiàn)在同卵雙胞胎中調(diào)控元件甲基化存在300多個(gè)差異，以及結(jié)合其他大量例子得出調(diào)控元件有高的組織和發(fā)育特異性的結(jié)論。其次，他介紹了人基因組存在大量轉(zhuǎn)座子，轉(zhuǎn)座子是存在于染色體DNA上可以自主復(fù)制和位移的一段DNA序列，在基因組上多個(gè)位置存在，因此在以往基因組回帖的時(shí)候都被丟棄了，現(xiàn)在他們用了一個(gè)新的方法可以回收70%丟棄的測序數(shù)據(jù)。通過不同組織甲基化測序的研究，發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄元件在腫瘤細(xì)胞表觀修飾的改變中是重要的位點(diǎn)。報(bào)告結(jié)束后，張博詳細(xì)解答了在場科技人員和研究生提出的問題。
張博，博士，現(xiàn)為圣路易斯華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院（Washington University School of Medicine in St. Louis)發(fā)育生物學(xué)系助理教授、華盛頓大學(xué)再生醫(yī)學(xué)研究中心生物信息平臺(tái)主管。主要從事生物信息學(xué)與表觀遺傳學(xué)研究，參與Human Roadmap Epigenome project和ENCODE Project，負(fù)責(zé)算法開發(fā)與數(shù)據(jù)整合分析。同時(shí)，領(lǐng)導(dǎo)TaRGET II consortium數(shù)據(jù)整合中心的數(shù)據(jù)分析工作。
期間，張博與中科院熱帶植物資源可持續(xù)利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室研究員劉長寧、研究員徐增富、副研究員陳茂盛等科技人員進(jìn)行了學(xué)術(shù)交流。
張博作報(bào)告
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