澳大利亞國立大學(xué)林宇博士做客“蔡希陶論壇”
應(yīng)中科院熱帶植物資源可持續(xù)利用重點實驗室生物信息研究組劉長寧研究員的邀請,4月10日至11日,澳大利亞國立大學(xué)助理教授林宇博士訪問版納植物園,并在熱帶植物資源可持續(xù)利用重點實驗室舉辦的系列學(xué)術(shù)報告“蔡希陶論壇”第26期作學(xué)術(shù)報告。
4月11日下午,林宇博士作了題為“Genome Assembly for Third-Generation Sequencing(三代測序數(shù)據(jù)組裝)”的學(xué)術(shù)報告。他系統(tǒng)地介紹了一代、二代和三代測序數(shù)據(jù)的特點和已有的組裝算法,并展示如何推廣De Brujin圖模型來拼接三代測序數(shù)據(jù)(A-Brujin圖)。報告結(jié)束后,林宇助博士詳細解答了在場科研人員和研究生提出的問題。訪問期間,林宇博士還與熱帶植物資源可持續(xù)利用重點實驗室劉長寧研究員、徐進研究員、潘幫珍、陳茂盛,以及熱帶森林生態(tài)學(xué)重點實驗室的王剛等進行了學(xué)術(shù)交流,為今后雙方順利開展相關(guān)合作研究奠定了很好的基礎(chǔ)。
林宇博士現(xiàn)任澳大利亞國立大學(xué)助理教授;在瑞士聯(lián)邦理工洛桑分校(EPFL)Bernard Moret教授指導(dǎo)下獲得計算機博士學(xué)位,后在加州大學(xué)圣地亞哥分校(UCSD)Pavel Pevzner實驗室從事博后研究。目前主要從事計算生物學(xué)的研究,包括基因組拼接、基因組重排和系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建的模型和算法,并兩次獲得瑞士自然科學(xué)基金委的項目資助。其多篇論文發(fā)表在PNAS、BMC bioinformatics等期刊上。
林宇博士作報告